Guía a Ryu Hayabusa por una misión que tiene como fin vengar a su clan, y prevenir el exterminio total de la raza humana. Armado con toda una variedad de armas ninja, ayuda a Ryu a maniobrar con habilidad a través de un mundo repleto de peligros y amenazas. Ninja Gaiden 2 presenta un motor completamente renovado, un nuevo sistema de auto-regeneración, nuevos niveles, aventuras, enemigos, y combate frenético con un extenso -e inédito- arsenal ninja, que representa una verdadera evolución dentro de esta exitosa serie.